# This file was created Thu Feb 4 21:05:17 2021 # Created by: # :-) GROMACS - gmx rdf, 2019.6 (-: # # Executable: /usr/bin/gmx # Data prefix: /usr # Working dir: /home/victoal/AZOTMA_PMF/equilibrated_micelles/P30/RDFs # Command line: # gmx rdf -f ../P30_equil_md80ns.xtc -s ../P30_equil_md80ns.gro -b 2000 -n index_groups.ndx -bin 0.02 -norm number_density -ref 'com of group 1' -sel 13 14 15 16 17 18 11 # gmx rdf is part of G R O M A C S: # # Good gRace! Old Maple Actually Chews Slate # @ title "Radial distribution" @ xaxis label "r (nm)" @ yaxis label "g(r)" @TYPE xy @ subtitle "reference com of group 1" @ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85 @ legend on @ legend box on @ legend loctype view @ legend 0.78, 0.8 @ legend length 2 @ s0 legend "CA_CB_CC_CD" @ s1 legend "CE_CF1_CF2_CG1_CG2_CH" @ s2 legend "NA_NB" @ s3 legend "CI_CJ1_CJ2_CK1_CK2_CL" @ s4 legend "O_CM_CN_CZ" @ s5 legend "N_C1_C2_C3" @ s6 legend "BR" 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020 9.663 16.910 2.416 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040 9.613 2.564 0.000 0.000 1.282 0.000 0.000 0.060 12.677 7.203 1.441 0.864 0.000 0.000 0.000 0.080 12.204 7.159 1.302 0.488 0.814 0.163 0.000 0.100 15.024 8.868 0.835 0.835 0.417 0.104 0.000 0.120 13.707 6.890 0.218 0.653 0.290 0.000 0.073 0.140 12.316 7.944 0.427 0.693 0.427 0.373 0.000 0.160 13.476 7.106 0.898 0.898 0.286 0.245 0.000 0.180 12.942 7.488 0.420 0.775 0.323 0.194 0.065 0.200 12.107 7.138 0.967 0.654 0.209 0.261 0.105 0.220 12.147 8.018 0.627 0.584 0.367 0.238 0.086 0.240 11.134 8.010 0.581 0.672 0.091 0.218 0.036 0.260 10.447 7.863 0.851 0.913 0.248 0.232 0.031 0.280 10.103 7.674 0.641 0.868 0.200 0.240 0.080 0.300 10.197 7.627 0.744 0.919 0.209 0.291 0.012 0.320 9.340 7.511 0.674 0.818 0.112 0.204 0.010 0.340 9.351 7.559 0.742 0.923 0.290 0.172 0.045 0.360 9.577 8.406 0.759 0.743 0.226 0.186 0.024 0.380 9.364 8.226 0.855 0.891 0.203 0.181 0.022 0.400 9.059 8.124 1.092 0.922 0.222 0.222 0.026 0.420 9.066 9.119 1.139 0.854 0.303 0.249 0.024 0.440 9.012 8.655 1.146 1.114 0.211 0.184 0.027 0.460 8.839 9.235 1.335 1.172 0.208 0.247 0.049 0.480 9.145 9.876 1.295 1.204 0.268 0.145 0.023 0.500 8.784 9.696 1.608 1.344 0.247 0.222 0.038 0.520 9.507 10.080 1.599 1.448 0.337 0.217 0.035 0.540 8.834 10.944 1.680 1.587 0.298 0.251 0.018 0.560 9.159 10.907 1.886 1.849 0.287 0.207 0.040 0.580 9.051 11.397 1.929 1.749 0.289 0.212 0.034 0.600 8.725 11.086 1.928 1.893 0.334 0.198 0.020 0.620 8.547 11.426 1.876 2.148 0.278 0.264 0.022 0.640 8.034 11.275 1.911 2.264 0.317 0.225 0.028 0.660 8.021 11.767 2.211 2.429 0.370 0.228 0.029 0.680 7.613 11.705 2.193 2.635 0.358 0.220 0.034 0.700 7.088 11.439 2.324 2.794 0.425 0.237 0.036 0.720 7.013 11.224 2.298 2.936 0.412 0.232 0.028 0.740 6.400 11.343 2.401 3.152 0.405 0.241 0.021 0.760 6.046 10.888 2.499 3.287 0.437 0.250 0.025 0.780 5.901 10.794 2.503 3.620 0.444 0.225 0.031 0.800 5.613 10.546 2.617 3.788 0.464 0.247 0.029 0.820 5.525 10.495 2.832 4.132 0.495 0.229 0.022 0.840 5.395 10.052 2.943 4.323 0.555 0.240 0.021 0.860 5.225 9.948 3.193 4.629 0.543 0.221 0.030 0.880 5.073 9.877 3.124 4.997 0.620 0.207 0.030 0.900 4.842 9.761 3.228 5.294 0.658 0.233 0.021 0.920 4.737 9.889 3.319 5.684 0.727 0.236 0.031 0.940 4.638 9.655 3.485 6.074 0.776 0.208 0.030 0.960 4.558 9.640 3.474 6.642 0.881 0.221 0.020 0.980 4.627 9.578 3.536 6.819 1.009 0.254 0.021 1.000 4.487 9.225 3.572 7.247 1.085 0.267 0.026 1.020 4.386 9.303 3.651 7.569 1.155 0.229 0.024 1.040 4.374 8.866 3.614 7.896 1.285 0.284 0.041 1.060 4.218 8.639 3.641 8.305 1.435 0.304 0.022 1.080 4.128 8.465 3.447 8.298 1.566 0.289 0.023 1.100 3.990 8.164 3.403 8.369 1.692 0.287 0.027 1.120 3.991 7.624 3.307 8.473 1.904 0.358 0.039 1.140 3.967 7.245 3.107 8.335 2.010 0.371 0.024 1.160 3.697 6.798 2.855 8.225 2.199 0.387 0.030 1.180 3.745 6.498 2.680 8.247 2.333 0.471 0.034 1.200 3.551 6.014 2.398 7.889 2.552 0.473 0.025 1.220 3.450 5.605 2.318 7.610 2.645 0.536 0.038 1.240 3.288 5.151 2.008 7.283 2.724 0.620 0.035 1.260 3.079 4.804 1.883 7.093 2.916 0.655 0.035 1.280 3.053 4.373 1.735 6.724 3.024 0.726 0.036 1.300 2.885 3.947 1.531 6.419 3.177 0.849 0.051 1.320 2.728 3.491 1.375 5.940 3.156 0.935 0.046 1.340 2.560 3.129 1.244 5.572 3.259 1.032 0.061 1.360 2.376 2.888 1.101 5.187 3.315 1.140 0.046 1.380 2.208 2.531 0.966 4.799 3.235 1.271 0.064 1.400 1.982 2.190 0.811 4.443 3.348 1.331 0.070 1.420 1.955 1.982 0.742 4.150 3.268 1.527 0.070 1.440 1.751 1.759 0.675 3.781 3.234 1.619 0.072 1.460 1.547 1.529 0.596 3.438 3.172 1.721 0.091 1.480 1.430 1.351 0.526 3.125 3.124 1.853 0.098 1.500 1.316 1.199 0.461 2.829 3.031 1.937 0.100 1.520 1.130 1.065 0.419 2.615 2.964 1.999 0.112 1.540 1.017 0.975 0.374 2.381 2.846 2.059 0.135 1.560 0.906 0.864 0.318 2.165 2.718 2.177 0.135 1.580 0.813 0.808 0.307 1.931 2.642 2.176 0.165 1.600 0.734 0.691 0.280 1.752 2.512 2.204 0.174 1.620 0.640 0.614 0.268 1.562 2.358 2.203 0.172 1.640 0.556 0.589 0.232 1.485 2.302 2.256 0.200 1.660 0.510 0.536 0.216 1.296 2.180 2.244 0.199 1.680 0.440 0.510 0.202 1.163 2.025 2.249 0.208 1.700 0.405 0.452 0.184 1.038 1.937 2.256 0.211 1.720 0.369 0.410 0.158 0.965 1.753 2.180 0.230 1.740 0.328 0.410 0.161 0.873 1.662 2.192 0.248 1.760 0.293 0.370 0.147 0.780 1.563 2.181 0.226 1.780 0.274 0.348 0.127 0.705 1.495 2.117 0.260 1.800 0.247 0.331 0.126 0.662 1.329 2.079 0.245 1.820 0.231 0.305 0.110 0.622 1.255 2.029 0.265 1.840 0.234 0.303 0.110 0.556 1.173 1.932 0.273 1.860 0.213 0.284 0.102 0.502 1.082 1.889 0.263 1.880 0.208 0.278 0.104 0.459 0.983 1.858 0.262 1.900 0.191 0.252 0.098 0.430 0.910 1.688 0.255 1.920 0.188 0.287 0.100 0.391 0.860 1.656 0.252 1.940 0.176 0.250 0.078 0.379 0.768 1.573 0.256 1.960 0.170 0.245 0.100 0.367 0.698 1.457 0.270 1.980 0.172 0.237 0.089 0.329 0.668 1.426 0.242 2.000 0.157 0.227 0.085 0.315 0.603 1.318 0.236 2.020 0.146 0.225 0.073 0.307 0.551 1.253 0.211 2.040 0.155 0.218 0.068 0.299 0.501 1.160 0.208 2.060 0.150 0.215 0.074 0.271 0.474 1.110 0.195 2.080 0.145 0.210 0.083 0.257 0.412 1.031 0.207 2.100 0.146 0.203 0.064 0.256 0.395 0.978 0.184 2.120 0.140 0.200 0.069 0.243 0.355 0.899 0.186 2.140 0.145 0.208 0.066 0.234 0.342 0.835 0.173 2.160 0.134 0.201 0.066 0.236 0.321 0.772 0.163 2.180 0.133 0.196 0.069 0.232 0.287 0.686 0.154 2.200 0.132 0.192 0.064 0.212 0.271 0.667 0.156 2.220 0.138 0.182 0.067 0.217 0.246 0.597 0.142 2.240 0.133 0.184 0.055 0.212 0.246 0.551 0.143 2.260 0.131 0.174 0.063 0.216 0.224 0.538 0.128 2.280 0.124 0.189 0.061 0.208 0.202 0.474 0.126 2.300 0.116 0.179 0.061 0.202 0.188 0.427 0.122 2.320 0.130 0.176 0.069 0.196 0.181 0.400 0.121 2.340 0.117 0.189 0.059 0.188 0.168 0.396 0.110 2.360 0.121 0.177 0.060 0.176 0.170 0.348 0.112 2.380 0.121 0.181 0.057 0.174 0.157 0.330 0.106 2.400 0.119 0.183 0.062 0.179 0.158 0.302 0.096 2.420 0.117 0.165 0.058 0.181 0.150 0.279 0.097 2.440 0.115 0.167 0.050 0.168 0.141 0.258 0.092 2.460 0.118 0.175 0.056 0.163 0.127 0.234 0.086 2.480 0.102 0.175 0.052 0.159 0.136 0.210 0.082 2.500 0.116 0.169 0.049 0.171 0.124 0.211 0.072 2.520 0.108 0.166 0.050 0.153 0.127 0.190 0.077 2.540 0.111 0.165 0.057 0.167 0.122 0.176 0.070 2.560 0.105 0.167 0.055 0.154 0.126 0.164 0.071 2.580 0.110 0.166 0.055 0.158 0.117 0.157 0.065 2.600 0.108 0.172 0.054 0.153 0.104 0.154 0.067 2.620 0.106 0.170 0.056 0.151 0.106 0.146 0.065 2.640 0.110 0.163 0.056 0.153 0.109 0.150 0.070 2.660 0.113 0.158 0.056 0.154 0.112 0.126 0.063 2.680 0.108 0.152 0.056 0.145 0.115 0.138 0.060 2.700 0.105 0.166 0.054 0.161 0.102 0.123 0.058 2.720 0.104 0.159 0.051 0.152 0.103 0.128 0.057 2.740 0.105 0.166 0.050 0.159 0.106 0.123 0.055 2.760 0.104 0.159 0.055 0.150 0.105 0.123 0.050 2.780 0.096 0.155 0.051 0.160 0.100 0.114 0.047 2.800 0.104 0.162 0.051 0.150 0.099 0.117 0.049 2.820 0.104 0.161 0.053 0.153 0.097 0.114 0.048 2.840 0.099 0.156 0.054 0.146 0.099 0.112 0.049 2.860 0.094 0.153 0.051 0.148 0.095 0.106 0.047 2.880 0.095 0.137 0.046 0.143 0.092 0.108 0.046 2.900 0.102 0.153 0.052 0.150 0.103 0.102 0.040 2.920 0.098 0.145 0.048 0.153 0.105 0.111 0.044 2.940 0.095 0.141 0.047 0.141 0.093 0.102 0.045 2.960 0.098 0.145 0.050 0.152 0.096 0.105 0.039 2.980 0.094 0.147 0.048 0.143 0.096 0.098 0.042 3.000 0.092 0.141 0.046 0.154 0.094 0.102 0.040 3.020 0.092 0.151 0.049 0.146 0.096 0.091 0.039 3.040 0.097 0.146 0.052 0.150 0.093 0.092 0.041 3.060 0.095 0.130 0.045 0.140 0.098 0.099 0.041 3.080 0.095 0.136 0.045 0.143 0.100 0.089 0.042 3.100 0.094 0.137 0.048 0.145 0.096 0.099 0.031 3.120 0.093 0.140 0.044 0.142 0.096 0.094 0.033 3.140 0.095 0.136 0.048 0.148 0.091 0.093 0.033 3.160 0.087 0.136 0.046 0.136 0.096 0.093 0.034 3.180 0.097 0.138 0.048 0.139 0.088 0.099 0.034 3.200 0.090 0.132 0.047 0.141 0.092 0.092 0.037 3.220 0.091 0.130 0.044 0.138 0.095 0.093 0.035 3.240 0.088 0.131 0.048 0.141 0.093 0.096 0.036 3.260 0.085 0.135 0.047 0.137 0.091 0.095 0.034 3.280 0.094 0.126 0.040 0.128 0.097 0.089 0.035 3.300 0.091 0.131 0.045 0.138 0.091 0.093 0.032 3.320 0.088 0.127 0.043 0.125 0.095 0.086 0.033 3.340 0.087 0.130 0.043 0.136 0.092 0.095 0.030 3.360 0.084 0.128 0.044 0.137 0.094 0.092 0.031 3.380 0.082 0.130 0.042 0.130 0.093 0.089 0.035 3.400 0.088 0.131 0.041 0.130 0.095 0.087 0.031 3.420 0.081 0.133 0.041 0.135 0.092 0.085 0.029 3.440 0.086 0.120 0.042 0.132 0.093 0.088 0.029 3.460 0.085 0.129 0.040 0.131 0.089 0.092 0.030 3.480 0.087 0.121 0.045 0.131 0.089 0.086 0.029 3.500 0.086 0.125 0.042 0.129 0.091 0.085 0.030 3.520 0.085 0.129 0.039 0.125 0.087 0.087 0.029 3.540 0.083 0.124 0.041 0.136 0.090 0.087 0.030 3.560 0.085 0.123 0.044 0.127 0.088 0.090 0.029 3.580 0.082 0.128 0.039 0.125 0.089 0.083 0.028 3.600 0.082 0.121 0.039 0.127 0.085 0.085 0.025 3.620 0.083 0.124 0.041 0.123 0.088 0.084 0.026 3.640 0.083 0.122 0.042 0.120 0.083 0.089 0.027 3.660 0.078 0.120 0.039 0.126 0.079 0.081 0.027 3.680 0.082 0.120 0.041 0.126 0.081 0.083 0.028 3.700 0.081 0.122 0.041 0.124 0.080 0.085 0.028 3.720 0.080 0.123 0.044 0.126 0.077 0.080 0.026 3.740 0.081 0.120 0.042 0.121 0.079 0.081 0.027 3.760 0.083 0.116 0.038 0.121 0.083 0.077 0.026 3.780 0.082 0.120 0.041 0.124 0.080 0.079 0.027 3.800 0.080 0.120 0.043 0.125 0.081 0.078 0.022 3.820 0.079 0.116 0.043 0.123 0.076 0.077 0.024 3.840 0.083 0.119 0.040 0.121 0.079 0.078 0.025 3.860 0.078 0.119 0.040 0.120 0.079 0.074 0.024 3.880 0.077 0.112 0.042 0.122 0.077 0.074 0.026 3.900 0.075 0.119 0.043 0.123 0.079 0.077 0.023 3.920 0.082 0.117 0.038 0.114 0.079 0.075 0.023 3.940 0.081 0.119 0.040 0.117 0.077 0.073 0.022 3.960 0.077 0.114 0.040 0.120 0.076 0.076 0.022 3.980 0.080 0.120 0.039 0.117 0.076 0.071 0.020 4.000 0.075 0.116 0.041 0.118 0.076 0.074 0.022 4.020 0.078 0.118 0.040 0.115 0.080 0.071 0.022 4.040 0.077 0.119 0.036 0.114 0.079 0.074 0.022 4.060 0.075 0.118 0.041 0.115 0.074 0.077 0.023 4.080 0.078 0.119 0.038 0.114 0.075 0.070 0.024 4.100 0.077 0.117 0.037 0.112 0.072 0.071 0.024 4.120 0.073 0.118 0.039 0.118 0.072 0.074 0.023 4.140 0.078 0.121 0.038 0.116 0.070 0.068 0.024 4.160 0.078 0.116 0.038 0.111 0.072 0.073 0.021 4.180 0.073 0.116 0.039 0.111 0.072 0.069 0.023 4.200 0.075 0.117 0.037 0.111 0.070 0.070 0.022 4.220 0.074 0.117 0.037 0.112 0.071 0.072 0.019 4.240 0.073 0.117 0.039 0.114 0.069 0.072 0.020 4.260 0.072 0.116 0.038 0.112 0.072 0.071 0.019 4.280 0.073 0.113 0.038 0.108 0.070 0.070 0.021 4.300 0.076 0.118 0.034 0.107 0.069 0.067 0.023 4.320 0.073 0.108 0.036 0.107 0.071 0.067 0.020 4.340 0.075 0.111 0.037 0.110 0.069 0.067 0.021 4.360 0.075 0.109 0.037 0.106 0.067 0.066 0.019 4.380 0.073 0.109 0.036 0.108 0.068 0.066 0.021 4.400 0.071 0.108 0.037 0.101 0.067 0.063 0.019 4.420 0.070 0.109 0.035 0.108 0.065 0.066 0.021 4.440 0.073 0.110 0.037 0.104 0.068 0.064 0.019 4.460 0.073 0.109 0.035 0.103 0.066 0.062 0.020 4.480 0.072 0.109 0.035 0.105 0.069 0.069 0.018 4.500 0.075 0.105 0.035 0.102 0.065 0.061 0.019 4.520 0.071 0.103 0.035 0.103 0.067 0.060 0.020 4.540 0.070 0.104 0.035 0.103 0.065 0.064 0.019 4.560 0.069 0.107 0.033 0.101 0.068 0.061 0.019 4.580 0.070 0.106 0.033 0.102 0.070 0.063 0.019 4.600 0.069 0.101 0.033 0.102 0.062 0.061 0.021 4.620 0.072 0.099 0.037 0.100 0.064 0.061 0.018 4.640 0.069 0.103 0.035 0.097 0.063 0.065 0.019 4.660 0.070 0.099 0.034 0.096 0.066 0.060 0.021 4.680 0.072 0.108 0.035 0.101 0.064 0.063 0.019 4.700 0.065 0.102 0.035 0.095 0.063 0.063 0.020 4.720 0.066 0.102 0.034 0.095 0.064 0.064 0.019 4.740 0.068 0.102 0.033 0.098 0.062 0.062 0.018 4.760 0.064 0.104 0.033 0.098 0.059 0.061 0.017 4.780 0.066 0.096 0.033 0.094 0.062 0.060 0.019 4.800 0.067 0.102 0.033 0.095 0.064 0.061 0.017 4.820 0.065 0.099 0.033 0.096 0.060 0.062 0.018 4.840 0.066 0.101 0.030 0.097 0.061 0.062 0.020 4.860 0.065 0.098 0.033 0.094 0.060 0.061 0.018 4.880 0.062 0.096 0.032 0.092 0.061 0.060 0.016 4.900 0.062 0.095 0.031 0.093 0.061 0.060 0.017 4.920 0.064 0.093 0.031 0.094 0.060 0.062 0.018 4.940 0.066 0.098 0.031 0.095 0.060 0.058 0.018 4.960 0.063 0.093 0.031 0.091 0.057 0.059 0.016 4.980 0.061 0.093 0.028 0.087 0.058 0.060 0.018 5.000 0.064 0.094 0.032 0.090 0.058 0.060 0.017 5.020 0.059 0.095 0.032 0.088 0.059 0.059 0.018 5.040 0.060 0.090 0.031 0.089 0.062 0.060 0.018 5.060 0.061 0.091 0.030 0.087 0.059 0.057 0.017 5.080 0.062 0.093 0.029 0.086 0.059 0.057 0.016 5.100 0.059 0.091 0.031 0.089 0.057 0.057 0.017 5.120 0.062 0.086 0.029 0.087 0.059 0.054 0.017 5.140 0.058 0.089 0.030 0.088 0.057 0.056 0.017 5.160 0.058 0.084 0.028 0.088 0.056 0.054 0.017 5.180 0.057 0.088 0.030 0.086 0.056 0.056 0.017 5.200 0.061 0.084 0.029 0.088 0.056 0.052 0.016 5.220 0.060 0.085 0.028 0.084 0.054 0.056 0.016 5.240 0.058 0.080 0.028 0.087 0.055 0.055 0.017 5.260 0.058 0.087 0.027 0.085 0.054 0.052 0.016 5.280 0.055 0.083 0.028 0.085 0.056 0.054 0.016 5.300 0.055 0.083 0.027 0.082 0.054 0.055 0.015 5.320 0.055 0.083 0.027 0.081 0.053 0.052 0.016 5.340 0.057 0.081 0.028 0.082 0.052 0.052 0.017 5.360 0.053 0.079 0.029 0.081 0.054 0.051 0.014 5.380 0.055 0.082 0.026 0.079 0.050 0.052 0.016 5.400 0.053 0.080 0.027 0.078 0.052 0.053 0.016 5.420 0.054 0.078 0.027 0.081 0.051 0.053 0.016 5.440 0.052 0.074 0.025 0.076 0.047 0.047 0.016