#!/bin/bash

PRMTOP="../E461K_apo_sol.prmtop"
TRAJ="heile_driten.nc"

type="inter_ring_distance"
#type="reimage"
#type="rmsd"
#type="short"
#type="cluster"
#type="mmtsb_clustering"
#type=qha
#type=correl
#type=proj
ptraj_file=${type}.ptraj

if [ -f $ptraj_file ]; then
	rm $ptraj_file
fi
echo 'trajin '${TRAJ} $OFFSET >> $ptraj_file 

echo `cat $type >> $ptraj_file`

ptraj $PRMTOP $ptraj_file