Probleem met charmm: residu nummers moeten steeds vanaf 1 beginnen (dus structuur hernummert met genconf)

ook zien dat de juiste dirs aangemaakt worden: pdb, dcd, rst, ...

nakijken voor disulfide bruggen

inloggen op korgpil en dan:
/net/orinoco/apps/charmm/c33b1/exec/gnu/charmm_xxlarge < mini_helix.inp > mini_helix.out &